Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 GRIN1-205ENST00000371555 4003 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 FAM71E2-201ENST00000424985 3191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 PLIN3-201ENST00000221957 2333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 BAIAP2L1-201ENST00000005260 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 MEP1A-201ENST00000230588 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 AC010547.1-201ENST00000500612 2793 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 LINC01756-201ENST00000417651 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 SEC24B-201ENST00000265175 5083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 NDUFAF7-201ENST00000002125 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 TSN-201ENST00000389682 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 WDR47-204ENST00000369965 4240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 GUCY2D-201ENST00000254854 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 PRPF4-201ENST00000374198 2787 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 KCNMA1-232ENST00000638306 3811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 SLC26A6-205ENST00000395550 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 IL12RB1-207ENST00000600835 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 EIF4G1-205ENST00000382330 5129 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 ACTN1-202ENST00000376839 2824 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 WDR73-202ENST00000434634 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 PID1-204ENST00000409462 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 RAB37-203ENST00000392612 2528 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 KCND1-201ENST00000218176 4437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 CNTNAP5-202ENST00000431078 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 PAK3-211ENST00000518291 2098 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 CPN2-201ENST00000323830 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 EMBP1-203ENST00000622787 4235 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 DNAJB12-202ENST00000394903 3198 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 CACNA1G-209ENST00000502264 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 CACNA1G-221ENST00000510115 6912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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UBXN4Q92575 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 C9orf170-201ENST00000623052 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 CACNB1-202ENST00000394303 3742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 C19orf12-208ENST00000614091 4489 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 SLC4A1-201ENST00000262418 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 DGKA-202ENST00000394147 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 APOBR-201ENST00000431282 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 NXPE3-201ENST00000273347 3941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 SEMA4D-212ENST00000450295 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 RSPO2-201ENST00000276659 3111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 GSTM3-201ENST00000256594 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 DNMT3B-203ENST00000348286 4048 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 BEND6-202ENST00000370746 2379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 METAP1-201ENST00000296411 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 VSTM2A-201ENST00000302287 3401 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 DRG2-202ENST00000395726 1897 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 LLGL1-203ENST00000621229 3187 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 KIF3A-208ENST00000618515 3333 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 GRM7-201ENST00000357716 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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