Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 DCAF12L1-201ENST00000371126 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 ABCB9-201ENST00000280560 3517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 AC021752.1-202ENST00000613161 2398 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 AC145098.2-201ENST00000623593 3026 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 C9orf106-201ENST00000316786 3145 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 CLCNKB-202ENST00000375679 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 FRMD1-205ENST00000440994 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
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CUL3Q13618 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 PIP5K1A-204ENST00000409426 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 C10orf105-202ENST00000441508 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
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CUL3Q13618 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
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CUL3Q13618 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
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CUL3Q13618 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 SLC26A6-205ENST00000395550 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 GRM1-202ENST00000355289 3874 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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