Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK8P49336 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK8P49336 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK8P49336 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK8P49336 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK8P49336 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK8P49336 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK8P49336 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK8P49336 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK8P49336 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK8P49336 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK8P49336 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK8P49336 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK8P49336 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK8P49336 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK8P49336 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK8P49336 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK8P49336 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK8P49336 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK8P49336 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK8P49336 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK8P49336 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK8P49336 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK8P49336 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK8P49336 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK8P49336 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK8P49336 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK8P49336 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK8P49336 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK8P49336 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK8P49336 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK8P49336 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK8P49336 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK8P49336 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK8P49336 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK8P49336 ADSSL1-208ENST00000555674 520 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK8P49336 AC068152.1-205ENST00000575173 1081 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK8P49336 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK8P49336 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK8P49336 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK8P49336 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK8P49336 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK8P49336 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK8P49336 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK8P49336 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK8P49336 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK8P49336 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK8P49336 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK8P49336 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK8P49336 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK8P49336 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK8P49336 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK8P49336 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK8P49336 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK8P49336 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK8P49336 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK8P49336 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK8P49336 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK8P49336 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK8P49336 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK8P49336 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK8P49336 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK8P49336 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK8P49336 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK8P49336 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK8P49336 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK8P49336 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK8P49336 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK8P49336 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK8P49336 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK8P49336 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK8P49336 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK8P49336 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK8P49336 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK8P49336 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK8P49336 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK8P49336 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK8P49336 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK8P49336 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK8P49336 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK8P49336 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK8P49336 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK8P49336 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK8P49336 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK8P49336 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK8P49336 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK8P49336 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK8P49336 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK8P49336 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK8P49336 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK8P49336 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK8P49336 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK8P49336 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK8P49336 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK8P49336 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK8P49336 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK8P49336 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK8P49336 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK8P49336 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK8P49336 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms