Protein–RNA interactions for Protein: Q9QC07

ERVK-18, Endogenous retrovirus group K member 18 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-18Q9QC07 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 HTR4-203ENST00000377888 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 CSTF2-203ENST00000415585 2074 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 CSNK1G1-205ENST00000607537 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 FBLN2-207ENST00000492059 4193 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 PARP10-205ENST00000525773 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 KCNIP3-201ENST00000295225 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 NDUFAF7-201ENST00000002125 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 ALG8-202ENST00000376156 1677 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 UBE2I-202ENST00000355803 3253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 SPCS3-201ENST00000503362 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 NEK3-205ENST00000610828 2396 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 APLP2-202ENST00000278756 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 AC092117.1-201ENST00000621230 3250 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 ZNF571-AS1-203ENST00000586139 2684 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 ZFYVE19-209ENST00000564258 2059 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 ARHGAP45-210ENST00000590214 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 CACNA1G-232ENST00000515411 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 LAIR1-204ENST00000391743 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 AGAP6-202ENST00000412531 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 CNKSR3-204ENST00000479339 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 ZWILCH-203ENST00000535141 2206 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 TRPM5-203ENST00000533060 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 AC092028.1-202ENST00000641483 3547 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 AC092028.1-201ENST00000641781 3540 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 SLC16A2-201ENST00000587091 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVK-18Q9QC07 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms