Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 AC104212.2-201ENST00000478813 628 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 ADSSL1-208ENST00000555674 520 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 LINC01922-202ENST00000567168 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms