Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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