Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DMDP11532 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DMDP11532 CCDC42-201ENST00000293845 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DMDP11532 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DMDP11532 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DMDP11532 AC024475.2-201ENST00000312173 879 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
DMDP11532 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DMDP11532 LINC02151-201ENST00000452629 921 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DMDP11532 SSR3-202ENST00000463503 596 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DMDP11532 GOLGA2-210ENST00000490628 428 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DMDP11532 AC109830.1-203ENST00000506638 467 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DMDP11532 SLC50A1-214ENST00000622581 1245 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DMDP11532 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DMDP11532 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DMDP11532 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DMDP11532 HSD3B2-206ENST00000543831 1783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DMDP11532 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DMDP11532 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DMDP11532 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DMDP11532 AL590399.1-202ENST00000429818 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DMDP11532 AL512625.1-202ENST00000476224 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DMDP11532 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DMDP11532 UBIAD1-201ENST00000376804 825 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DMDP11532 SMIM26-202ENST00000435844 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DMDP11532 FHIT-205ENST00000476844 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DMDP11532 RRNAD1-211ENST00000524343 459 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DMDP11532 SNORD55-201ENST00000581525 80 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
DMDP11532 MGST3-214ENST00000627653 1130 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DMDP11532 AL669831.3-208ENST00000634337 891 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DMDP11532 AC139795.2-201ENST00000499900 1751 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DMDP11532 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DMDP11532 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DMDP11532 KATNAL1-202ENST00000380617 1634 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DMDP11532 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DMDP11532 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DMDP11532 SUCLG2-204ENST00000493112 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DMDP11532 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DMDP11532 CKS2-201ENST00000314355 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DMDP11532 OR7E122P-201ENST00000383606 1017 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
DMDP11532 AC138781.1-201ENST00000501322 505 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DMDP11532 HNRNPA1P69-201ENST00000552536 933 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
DMDP11532 SNHG21-205ENST00000561107 790 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DMDP11532 CD74-201ENST00000009530 981 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DMDP11532 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DMDP11532 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DMDP11532 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DMDP11532 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DMDP11532 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DMDP11532 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DMDP11532 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DMDP11532 M1AP-201ENST00000290536 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DMDP11532 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DMDP11532 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DMDP11532 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DMDP11532 AIMP2-203ENST00000400479 1107 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DMDP11532 AL133517.1-201ENST00000413412 748 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
DMDP11532 AL662797.1-201ENST00000442852 799 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DMDP11532 DNM1P17-201ENST00000512082 426 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
DMDP11532 MRNIP-216ENST00000521333 410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DMDP11532 Metazoa_SRP.97-201ENST00000618280 304 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
DMDP11532 GTF3A-209ENST00000640289 1098 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DMDP11532 NBEAP3-201ENST00000420638 1493 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
DMDP11532 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DMDP11532 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
DMDP11532 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DMDP11532 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DMDP11532 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DMDP11532 CLDN10-AS1-201ENST00000416909 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
DMDP11532 GOSR1-205ENST00000467337 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
DMDP11532 OPRM1-211ENST00000518759 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
DMDP11532 AP000439.1-201ENST00000544004 581 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.3
DMDP11532 AC089987.3-201ENST00000551847 588 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.3
DMDP11532 DHRS4L1-201ENST00000558293 855 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
DMDP11532 NRSN2-206ENST00000608736 712 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
DMDP11532 C17orf98-201ENST00000614158 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
DMDP11532 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
DMDP11532 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
DMDP11532 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
DMDP11532 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
DMDP11532 TMEM107-201ENST00000316425 756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DMDP11532 WSB1-203ENST00000427287 1149 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DMDP11532 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DMDP11532 LINC00700-202ENST00000438372 777 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DMDP11532 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DMDP11532 AC019118.1-201ENST00000454530 435 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DMDP11532 AL121790.2-201ENST00000553425 379 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DMDP11532 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
DMDP11532 WSB1-213ENST00000583193 552 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DMDP11532 AL136115.2-201ENST00000602889 587 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DMDP11532 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DMDP11532 KRT26-201ENST00000335552 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DMDP11532 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DMDP11532 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DMDP11532 FAM90A22P-201ENST00000400142 1395 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
DMDP11532 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DMDP11532 AC106017.1-201ENST00000428348 440 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DMDP11532 AC007952.3-201ENST00000442355 440 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DMDP11532 AC007952.8-202ENST00000495691 440 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DMDP11532 AP001775.1-201ENST00000532608 586 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
DMDP11532 AC002347.2-201ENST00000584139 171 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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