Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 ELFN1-AS1-201ENST00000415399 636 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AC005077.3-201ENST00000449614 213 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AC005009.2-201ENST00000452471 687 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 ERG-211ENST00000453032 1595 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
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