Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 ENSA-208ENST00000369014 2085 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 ADCK1-201ENST00000238561 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 AC012358.2-201ENST00000430010 1434 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 CACNB4-201ENST00000201943 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 CD9-212ENST00000610354 1315 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 FCRLA-202ENST00000294796 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 AC053503.4-201ENST00000431827 224 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 AC012100.1-201ENST00000470304 282 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 RPL30-213ENST00000523172 274 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 AP003108.1-201ENST00000534856 554 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 IFI27L1-203ENST00000553664 647 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 AC131274.3-201ENST00000578745 1271 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 AC015818.3-201ENST00000583797 589 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 ZNF677-207ENST00000598806 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 Metazoa_SRP.64-201ENST00000611904 268 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 AL158032.2-201ENST00000616818 195 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 AL139260.3-204ENST00000621281 609 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 GPHB5-202ENST00000621500 543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 SLC50A1-214ENST00000622581 1245 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 VAPB-202ENST00000395802 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 OR52N1-201ENST00000317078 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 SCGB1C1-201ENST00000342878 431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 CST11-202ENST00000377009 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 OR2T32P-201ENST00000403423 963 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 LINC01494-201ENST00000419511 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 AC138392.1-201ENST00000427577 921 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 AC002066.1-201ENST00000446355 514 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 RN7SL340P-201ENST00000470792 296 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 LRRC75A-AS1-208ENST00000480811 968 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 FPGT-205ENST00000482102 561 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 RASGRF2-AS1-202ENST00000505694 535 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 RPL30P11-202ENST00000509114 358 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 AL390726.3-201ENST00000567428 635 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 INCA1-202ENST00000574617 1260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 MIR4539-201ENST00000579784 60 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 AL109983.1-201ENST00000603234 646 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 AC091905.3-201ENST00000624959 234 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 TCP1-215ENST00000544255 1403 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms