Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP5P45974 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP5P45974 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP5P45974 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP5P45974 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP5P45974 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP5P45974 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP5P45974 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP5P45974 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP5P45974 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP5P45974 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP5P45974 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP5P45974 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP5P45974 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP5P45974 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP5P45974 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP5P45974 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP5P45974 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP5P45974 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
USP5P45974 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
USP5P45974 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP5P45974 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP5P45974 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
USP5P45974 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP5P45974 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP5P45974 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP5P45974 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP5P45974 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP5P45974 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP5P45974 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP5P45974 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP5P45974 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP5P45974 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP5P45974 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP5P45974 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP5P45974 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP5P45974 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP5P45974 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP5P45974 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
USP5P45974 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP5P45974 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP5P45974 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP5P45974 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP5P45974 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP5P45974 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP5P45974 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP5P45974 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP5P45974 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP5P45974 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP5P45974 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP5P45974 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP5P45974 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP5P45974 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP5P45974 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP5P45974 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
USP5P45974 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP5P45974 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP5P45974 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP5P45974 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP5P45974 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP5P45974 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP5P45974 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP5P45974 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP5P45974 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP5P45974 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP5P45974 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP5P45974 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
USP5P45974 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP5P45974 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP5P45974 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP5P45974 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
USP5P45974 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP5P45974 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP5P45974 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
USP5P45974 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP5P45974 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP5P45974 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP5P45974 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP5P45974 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
USP5P45974 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
USP5P45974 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
USP5P45974 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP5P45974 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP5P45974 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP5P45974 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP5P45974 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP5P45974 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP5P45974 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP5P45974 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP5P45974 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP5P45974 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
USP5P45974 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
USP5P45974 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP5P45974 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP5P45974 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP5P45974 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP5P45974 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP5P45974 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP5P45974 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP5P45974 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms