Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIG1P18858 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIG1P18858 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIG1P18858 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIG1P18858 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIG1P18858 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LIG1P18858 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIG1P18858 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LIG1P18858 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIG1P18858 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIG1P18858 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIG1P18858 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIG1P18858 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIG1P18858 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIG1P18858 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIG1P18858 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIG1P18858 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIG1P18858 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIG1P18858 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIG1P18858 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIG1P18858 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIG1P18858 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIG1P18858 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIG1P18858 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIG1P18858 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIG1P18858 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIG1P18858 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIG1P18858 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIG1P18858 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIG1P18858 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIG1P18858 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIG1P18858 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LIG1P18858 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIG1P18858 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIG1P18858 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIG1P18858 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIG1P18858 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIG1P18858 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIG1P18858 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIG1P18858 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIG1P18858 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LIG1P18858 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIG1P18858 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIG1P18858 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LIG1P18858 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LIG1P18858 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIG1P18858 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIG1P18858 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LIG1P18858 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIG1P18858 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LIG1P18858 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIG1P18858 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LIG1P18858 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LIG1P18858 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LIG1P18858 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LIG1P18858 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIG1P18858 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIG1P18858 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIG1P18858 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIG1P18858 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIG1P18858 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIG1P18858 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIG1P18858 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIG1P18858 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIG1P18858 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIG1P18858 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LIG1P18858 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIG1P18858 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIG1P18858 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LIG1P18858 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIG1P18858 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIG1P18858 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIG1P18858 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIG1P18858 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIG1P18858 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIG1P18858 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIG1P18858 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIG1P18858 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIG1P18858 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIG1P18858 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIG1P18858 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIG1P18858 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIG1P18858 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIG1P18858 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIG1P18858 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIG1P18858 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIG1P18858 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIG1P18858 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIG1P18858 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIG1P18858 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIG1P18858 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIG1P18858 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIG1P18858 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIG1P18858 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LIG1P18858 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIG1P18858 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIG1P18858 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIG1P18858 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIG1P18858 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIG1P18858 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms