Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CFTRP13569 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFTRP13569 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFTRP13569 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CFTRP13569 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFTRP13569 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFTRP13569 TFAM-201ENST00000373895 973 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFTRP13569 IGFL4-201ENST00000377697 573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFTRP13569 FAM138A-201ENST00000417324 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFTRP13569 RN7SL16P-201ENST00000476316 269 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CFTRP13569 FAM138D-201ENST00000504074 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFTRP13569 FAM138E-201ENST00000507796 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFTRP13569 ROM1-205ENST00000534093 862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFTRP13569 AC007728.1-202ENST00000564510 787 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFTRP13569 AC008982.1-201ENST00000594769 963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFTRP13569 UBA52-214ENST00000599595 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFTRP13569 Metazoa_SRP.67-201ENST00000617099 296 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CFTRP13569 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFTRP13569 NAMA-207ENST00000605707 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFTRP13569 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFTRP13569 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFTRP13569 AHCYP7-201ENST00000560847 1308 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CFTRP13569 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFTRP13569 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFTRP13569 CACNA2D4-209ENST00000538450 1498 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFTRP13569 CLUHP8-201ENST00000547527 1485 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CFTRP13569 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFTRP13569 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFTRP13569 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFTRP13569 AC020741.1-201ENST00000381217 2079 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFTRP13569 FAM86C1-202ENST00000359244 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFTRP13569 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CFTRP13569 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFTRP13569 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFTRP13569 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFTRP13569 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFTRP13569 ZFAND1-201ENST00000220669 1798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFTRP13569 ZFAND1-221ENST00000523096 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFTRP13569 LINC01494-201ENST00000419511 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFTRP13569 STEAP2-AS1-202ENST00000478318 627 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFTRP13569 AC016650.1-201ENST00000502834 708 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFTRP13569 AC009119.3-202ENST00000566773 196 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFTRP13569 AC012146.4-201ENST00000575546 271 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CFTRP13569 RN7SL5P-201ENST00000581458 321 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CFTRP13569 AP005264.6-203ENST00000586882 1050 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFTRP13569 AC008894.2-202ENST00000599676 1027 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFTRP13569 AC091736.1-201ENST00000609370 305 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CFTRP13569 HIST1H4K-201ENST00000611927 312 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFTRP13569 Metazoa_SRP.68-201ENST00000612673 282 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CFTRP13569 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFTRP13569 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFTRP13569 CNOT4-204ENST00000414802 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFTRP13569 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFTRP13569 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFTRP13569 HOXA1-202ENST00000355633 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFTRP13569 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CFTRP13569 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFTRP13569 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFTRP13569 FAM25A-201ENST00000343959 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFTRP13569 COX4I2-201ENST00000376075 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFTRP13569 AL512422.2-201ENST00000426453 551 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFTRP13569 OR52X1P-201ENST00000446117 914 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CFTRP13569 AL157823.2-201ENST00000452048 669 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFTRP13569 NUP210P2-201ENST00000510577 282 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CFTRP13569 AC009646.2-202ENST00000524425 826 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFTRP13569 TATDN3-208ENST00000526997 794 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFTRP13569 TATDN3-213ENST00000531963 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFTRP13569 FP325317.1-201ENST00000539936 1042 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CFTRP13569 AC131009.2-201ENST00000542763 770 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFTRP13569 METTL23-211ENST00000589977 617 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFTRP13569 PSME3-213ENST00000592169 826 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFTRP13569 AC108673.2-201ENST00000608909 565 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CFTRP13569 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFTRP13569 OPRM1-210ENST00000452687 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFTRP13569 COMMD10-207ENST00000632434 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFTRP13569 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFTRP13569 OR2A25-203ENST00000641663 1741 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFTRP13569 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFTRP13569 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFTRP13569 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFTRP13569 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFTRP13569 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFTRP13569 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFTRP13569 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFTRP13569 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFTRP13569 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CFTRP13569 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFTRP13569 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFTRP13569 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFTRP13569 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFTRP13569 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFTRP13569 SH3BGRL3-202ENST00000319041 768 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFTRP13569 AP000487.2-201ENST00000324630 394 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFTRP13569 TTC39A-204ENST00000371750 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFTRP13569 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFTRP13569 SFTPA2-202ENST00000372327 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFTRP13569 LIMS2-203ENST00000409254 867 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFTRP13569 AC091807.1-201ENST00000418838 1544 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CFTRP13569 AL049792.1-201ENST00000424708 1262 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CFTRP13569 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms