Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 LINC00967-203ENST00000518035 1502 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 SH3BGR-202ENST00000380631 780 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 PRR23A-201ENST00000383163 801 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 RNU1-80P-201ENST00000459500 161 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 MTHFD2P7-201ENST00000483867 983 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 AC137579.2-201ENST00000517714 551 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 METTL7AP1-201ENST00000547343 496 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 UCP2-202ENST00000536983 1413 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 OR2T8-201ENST00000319968 939 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 UBIAD1-201ENST00000376804 825 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 AP001615.1-201ENST00000423276 461 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 KCNK15-AS1-203ENST00000427598 862 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 AC098820.2-201ENST00000457694 666 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 PIGCP1-201ENST00000527583 895 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 TCL1A-209ENST00000557043 980 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 LINC00677-201ENST00000558224 486 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 NAA38-204ENST00000575208 529 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 AC008536.3-201ENST00000623282 1599 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 GSTT2-203ENST00000634759 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 OR2T8-202ENST00000641945 1226 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 HTD2-205ENST00000477305 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 NR1H4-203ENST00000392986 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 RPSAP69-201ENST00000445739 546 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 RPL29P2-201ENST00000488409 460 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 AIPL1-210ENST00000576307 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 RN7SL162P-201ENST00000579233 292 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 LINC02498-201ENST00000635390 1065 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 STK16-202ENST00000409260 1493 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms