Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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