Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms