Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGA3

HS2ST1, Heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS2ST1Q7LGA3 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HS2ST1Q7LGA3 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms