Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYB3

FOXD4L6, Forkhead box protein D4-like 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L6Q3SYB3 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 TUBGCP5-208ENST00000620435 3342 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF180-201ENST00000221327 4335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 IKZF1-206ENST00000359197 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 AC145098.2-201ENST00000623593 3026 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 PGBD1-201ENST00000259883 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 AC022400.8-201ENST00000623453 3599 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 CCDC97-201ENST00000269967 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 DRD2-208ENST00000542968 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms