Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms