Protein–RNA interactions for Protein: P54829

PTPN5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, humanhuman

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Length 565 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN5P54829 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 KIR2DL4-207ENST00000396293 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 AC093581.1-204ENST00000442606 390 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 AC093510.1-202ENST00000546238 442 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 PSME2-217ENST00000615264 874 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 PSME2-218ENST00000630027 185 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 AL008638.4-201ENST00000624792 1315 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 MAGEA7P-201ENST00000436482 942 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 RHOQP2-201ENST00000449922 579 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 PGAP2-207ENST00000463452 931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 TGFBI-207ENST00000508076 1034 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 AC012593.1-214ENST00000586952 767 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 PSMG2-210ENST00000590217 1036 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PTPN5P54829 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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