Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 LINC01922-202ENST00000567168 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 KRT37-201ENST00000225550 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 SNU13-204ENST00000402458 462 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms