Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 SIGLEC1-201ENST00000344754 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 TTYH3-204ENST00000407643 4537 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-203ENST00000636308 4646 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 FBN1-201ENST00000316623 11756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 RGS12-201ENST00000336727 4674 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 SYNCRIP-201ENST00000355238 6449 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 DNAH10OS-201ENST00000514254 5040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 HCFC1-202ENST00000369984 8375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 SNRK-201ENST00000296088 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 PTPRN2-203ENST00000389418 4706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 SMARCA2-209ENST00000382203 5867 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 PRR26-201ENST00000381489 7250 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 ZNF407-201ENST00000299687 7948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 ICOSLG-203ENST00000400379 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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PFDN4Q9NQP4 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 STARD8-203ENST00000374599 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 ZC3HAV1-201ENST00000242351 7100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 ITGAL-201ENST00000356798 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 MST1R-201ENST00000296474 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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