Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms