Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
EPCAMP16422 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 AC104212.2-201ENST00000478813 628 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms