Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC9.13□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 RALGAPB-201ENST00000262879 8663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 RALGAPB-203ENST00000397042 8652 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 MGA-212ENST00000619521 1496 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 KDM5B-203ENST00000367265 10345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 OPA3-201ENST00000263275 7828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.12□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 PTGES3L-201ENST00000409446 1781 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AC055713.1-201ENST00000498967 8279 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 MARVELD2-201ENST00000325631 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC9.12□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC9.12□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms