Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms