Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 ARSD-202ENST00000381154 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 KIAA0513-201ENST00000258180 7404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 SYMPK-214ENST00000599814 6537 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 DLGAP1-203ENST00000400147 5258 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 DLGAP1-206ENST00000400155 5257 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 UQCRB-201ENST00000287022 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 CYB5RL-201ENST00000287899 5777 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 PERP-201ENST00000421351 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 NUMA1-234ENST00000620566 7012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 CACNA1G-207ENST00000429973 7120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 CACNA1G-217ENST00000507336 7116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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