Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 KDF1-202ENST00000616918 1651 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 CMTM5-204ENST00000382809 378 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 AC007223.1-201ENST00000564076 572 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 INCA1-204ENST00000576820 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 AC005865.2-202ENST00000635814 725 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 AADACL4-201ENST00000376221 1575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 KRT8P6-201ENST00000399259 1207 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 SUMO1-206ENST00000409368 1187 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 OR4C14P-201ENST00000440929 923 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 RBM14-205ENST00000443702 732 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 LINC01444-201ENST00000580867 764 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 CYP1B1-AS1-204ENST00000589303 579 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 AL035427.1-201ENST00000602441 387 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 AC083798.2-202ENST00000609469 553 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 AC138627.1-201ENST00000641127 1257 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 RSPH4A-202ENST00000368580 1410 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 AC007431.1-201ENST00000578662 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 SFPQP1-201ENST00000446621 1786 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 AC026786.1-201ENST00000540096 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 XRN1-203ENST00000463916 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 LYPLA1-202ENST00000343231 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 SLC25A3-202ENST00000228318 1678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 CCL19-202ENST00000378800 414 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 AL359092.2-201ENST00000423330 585 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 AC009120.2-205ENST00000561921 490 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 AC100786.1-201ENST00000583018 513 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 AC012087.1-201ENST00000608068 809 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 Metazoa_SRP.173-201ENST00000614020 273 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 SNORA50D-202ENST00000627561 132 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 LINC02433-202ENST00000507108 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 ECI2-207ENST00000465828 1548 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 PGAP2-204ENST00000396991 1798 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 HLA-W-207ENST00000439514 771 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 FAM86JP-202ENST00000484500 988 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 AK2-208ENST00000487289 920 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 DIO3OS-211ENST00000557532 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 AC084262.1-201ENST00000567818 751 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 URGCP-MRPS24-201ENST00000603700 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 AL353581.1-201ENST00000606916 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 HIST1H3E-201ENST00000614911 462 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 AL450487.2-201ENST00000615934 407 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 CBR3-AS1-210ENST00000623484 392 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 CBR3-AS1-215ENST00000624086 594 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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