Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms