Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TPTEP56180 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TPTEP56180 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TPTEP56180 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TPTEP56180 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TPTEP56180 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TPTEP56180 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TPTEP56180 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TPTEP56180 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TPTEP56180 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
TPTEP56180 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TPTEP56180 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TPTEP56180 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
TPTEP56180 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TPTEP56180 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TPTEP56180 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TPTEP56180 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TPTEP56180 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TPTEP56180 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TPTEP56180 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TPTEP56180 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
TPTEP56180 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
TPTEP56180 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
TPTEP56180 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
TPTEP56180 ADAMTSL4-202ENST00000369038 4167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TPTEP56180 SPINT1-201ENST00000344051 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TPTEP56180 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TPTEP56180 AL390066.1-201ENST00000456414 2302 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TPTEP56180 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TPTEP56180 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TPTEP56180 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TPTEP56180 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TPTEP56180 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TPTEP56180 HSPB7-201ENST00000311890 2892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TPTEP56180 ADAM32-206ENST00000519315 2168 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TPTEP56180 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TPTEP56180 TRPM4-202ENST00000427978 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TPTEP56180 HSPH1-204ENST00000445273 4987 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TPTEP56180 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TPTEP56180 AGAP6-202ENST00000412531 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TPTEP56180 SLC5A8-201ENST00000536262 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TPTEP56180 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TPTEP56180 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TPTEP56180 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TPTEP56180 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TPTEP56180 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TPTEP56180 AC073335.2-201ENST00000610177 3441 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
TPTEP56180 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TPTEP56180 LENG8-201ENST00000326764 3991 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TPTEP56180 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TPTEP56180 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
TPTEP56180 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
TPTEP56180 MARCH10-201ENST00000311269 3090 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TPTEP56180 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TPTEP56180 SYNRG-229ENST00000621136 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TPTEP56180 PPP1R10-201ENST00000376511 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TPTEP56180 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TPTEP56180 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TPTEP56180 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TPTEP56180 SAP30BP-225ENST00000584667 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TPTEP56180 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TPTEP56180 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TPTEP56180 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
TPTEP56180 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
TPTEP56180 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TPTEP56180 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TPTEP56180 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TPTEP56180 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TPTEP56180 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TPTEP56180 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TPTEP56180 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
TPTEP56180 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TPTEP56180 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
TPTEP56180 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TPTEP56180 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TPTEP56180 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TPTEP56180 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TPTEP56180 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TPTEP56180 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TPTEP56180 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TPTEP56180 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TPTEP56180 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TPTEP56180 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TPTEP56180 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TPTEP56180 NR4A1-201ENST00000243050 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TPTEP56180 ATXN2L-201ENST00000325215 3788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TPTEP56180 DDX12P-201ENST00000432996 2947 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
TPTEP56180 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TPTEP56180 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TPTEP56180 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TPTEP56180 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TPTEP56180 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TPTEP56180 TRPM2-201ENST00000300481 5627 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TPTEP56180 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
TPTEP56180 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TPTEP56180 TACC2-209ENST00000369004 3667 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TPTEP56180 PGBD1-201ENST00000259883 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TPTEP56180 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TPTEP56180 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TPTEP56180 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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