Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK8P49336 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK8P49336 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK8P49336 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK8P49336 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK8P49336 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK8P49336 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK8P49336 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK8P49336 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK8P49336 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK8P49336 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK8P49336 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK8P49336 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK8P49336 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK8P49336 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK8P49336 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK8P49336 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK8P49336 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK8P49336 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK8P49336 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK8P49336 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK8P49336 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK8P49336 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK8P49336 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK8P49336 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK8P49336 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK8P49336 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK8P49336 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK8P49336 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK8P49336 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK8P49336 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK8P49336 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK8P49336 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK8P49336 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK8P49336 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK8P49336 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK8P49336 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK8P49336 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK8P49336 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK8P49336 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK8P49336 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK8P49336 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK8P49336 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK8P49336 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK8P49336 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK8P49336 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK8P49336 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK8P49336 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK8P49336 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK8P49336 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK8P49336 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK8P49336 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK8P49336 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK8P49336 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK8P49336 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK8P49336 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK8P49336 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK8P49336 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK8P49336 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK8P49336 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK8P49336 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK8P49336 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK8P49336 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK8P49336 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK8P49336 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK8P49336 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK8P49336 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK8P49336 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK8P49336 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK8P49336 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK8P49336 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK8P49336 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK8P49336 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK8P49336 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK8P49336 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK8P49336 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK8P49336 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK8P49336 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK8P49336 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK8P49336 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK8P49336 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK8P49336 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK8P49336 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK8P49336 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK8P49336 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK8P49336 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK8P49336 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK8P49336 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK8P49336 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK8P49336 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK8P49336 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK8P49336 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK8P49336 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK8P49336 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK8P49336 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK8P49336 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK8P49336 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK8P49336 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK8P49336 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK8P49336 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms