Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFNP31947 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFNP31947 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFNP31947 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SFNP31947 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFNP31947 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFNP31947 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SFNP31947 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFNP31947 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFNP31947 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFNP31947 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFNP31947 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFNP31947 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFNP31947 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFNP31947 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFNP31947 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFNP31947 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFNP31947 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SFNP31947 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SFNP31947 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SFNP31947 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFNP31947 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFNP31947 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SFNP31947 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SFNP31947 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFNP31947 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFNP31947 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFNP31947 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFNP31947 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFNP31947 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFNP31947 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SFNP31947 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFNP31947 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFNP31947 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFNP31947 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFNP31947 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFNP31947 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFNP31947 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFNP31947 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFNP31947 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFNP31947 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFNP31947 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SFNP31947 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFNP31947 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFNP31947 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFNP31947 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFNP31947 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFNP31947 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFNP31947 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFNP31947 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFNP31947 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFNP31947 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SFNP31947 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SFNP31947 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SFNP31947 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SFNP31947 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SFNP31947 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SFNP31947 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SFNP31947 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SFNP31947 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SFNP31947 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SFNP31947 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SFNP31947 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFNP31947 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFNP31947 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFNP31947 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFNP31947 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFNP31947 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFNP31947 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFNP31947 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFNP31947 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFNP31947 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFNP31947 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFNP31947 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFNP31947 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFNP31947 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFNP31947 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFNP31947 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFNP31947 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SFNP31947 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFNP31947 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFNP31947 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFNP31947 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SFNP31947 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFNP31947 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFNP31947 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFNP31947 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFNP31947 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFNP31947 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFNP31947 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFNP31947 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFNP31947 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFNP31947 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFNP31947 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFNP31947 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFNP31947 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFNP31947 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFNP31947 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFNP31947 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFNP31947 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms