Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 GPR12-202ENST00000405846 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 CYP11B1-204ENST00000517471 1874 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 KIZ-208ENST00000616848 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 DBIL5P-203ENST00000536214 2677 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 POM121L7P-201ENST00000329949 2404 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 TMPRSS13-201ENST00000430170 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 PHF19-202ENST00000373896 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 KCNH1-205ENST00000638498 3479 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 CSTF2-201ENST00000372972 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 GOLGA8O-201ENST00000509311 1997 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 PHF21B-203ENST00000403565 3586 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 CTRL-205ENST00000574481 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 AC004834.1-202ENST00000638785 1737 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 PTGR2-204ENST00000555228 2543 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 RGS12-201ENST00000336727 4674 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 ATG7-213ENST00000446450 2042 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 PLK4-209ENST00000513090 3123 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 GUCY2D-201ENST00000254854 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 NDRG2-201ENST00000298684 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 AC008040.5-201ENST00000599781 1781 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 LPP-AS2-201ENST00000605573 2852 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 ZBTB44-202ENST00000397753 3951 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 SLC8A3-205ENST00000394330 2622 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 ZSCAN5B-202ENST00000586855 2059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 PAPLN-203ENST00000554301 4090 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 HSP90AA1-202ENST00000334701 3510 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 CYP4F11-201ENST00000248041 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 AC112176.1-201ENST00000565428 3024 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 PACSIN1-207ENST00000620693 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 CICP9-201ENST00000444451 1913 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 CEP63-215ENST00000606977 2800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 AC005696.4-201ENST00000614400 3147 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 DRAM1-201ENST00000258534 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 URGCP-201ENST00000336086 5658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 TBC1D13-202ENST00000372648 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 MESD-201ENST00000261758 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 PI4KB-201ENST00000368872 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 SEC31A-208ENST00000448323 4255 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 AC020741.1-201ENST00000381217 2079 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 PLA2G15-201ENST00000219345 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 MFSD8-241ENST00000641686 4991 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 FAM184A-211ENST00000521531 3244 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 FAM105A-201ENST00000274217 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 ZNF148-206ENST00000485866 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 MAP1S-202ENST00000544059 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 MARCH3-201ENST00000308660 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 C14orf159-219ENST00000521077 2719 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms