Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ76

CNTNAP3, Contactin-associated protein-like 3, humanhuman

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Length 1,288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP3Q9BZ76 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CNTNAP3Q9BZ76 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CNTNAP3Q9BZ76 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CNTNAP3Q9BZ76 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CNTNAP3Q9BZ76 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CNTNAP3Q9BZ76 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CNTNAP3Q9BZ76 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CNTNAP3Q9BZ76 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CNTNAP3Q9BZ76 APOO-201ENST00000379226 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CNTNAP3Q9BZ76 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CNTNAP3Q9BZ76 SPTLC1P3-201ENST00000403408 259 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CNTNAP3Q9BZ76 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CNTNAP3Q9BZ76 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CNTNAP3Q9BZ76 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CNTNAP3Q9BZ76 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CNTNAP3Q9BZ76 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CNTNAP3Q9BZ76 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CNTNAP3Q9BZ76 AC004923.4-201ENST00000532296 739 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CNTNAP3Q9BZ76 AL136298.3-201ENST00000556746 445 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CNTNAP3Q9BZ76 Metazoa_SRP.64-201ENST00000611904 268 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CNTNAP3Q9BZ76 AC106782.5-201ENST00000616011 337 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CNTNAP3Q9BZ76 KRTAP10-4-202ENST00000616689 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CNTNAP3Q9BZ76 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CNTNAP3Q9BZ76 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CNTNAP3Q9BZ76 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CNTNAP3Q9BZ76 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CNTNAP3Q9BZ76 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CNTNAP3Q9BZ76 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 ZNRF4-201ENST00000222033 1426 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 RPL23A-204ENST00000422514 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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CNTNAP3Q9BZ76 FAM226B-201ENST00000602508 1490 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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CNTNAP3Q9BZ76 CELA3A-201ENST00000290122 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 PCP2-201ENST00000311069 776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 C6orf203-201ENST00000311381 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 GLRX2-202ENST00000367440 1131 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 OR52X1P-201ENST00000446117 914 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
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CNTNAP3Q9BZ76 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 AL358215.1-201ENST00000481350 482 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 AL450346.2-201ENST00000495602 1024 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 AC026150.1-201ENST00000562992 701 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 MIR1587-201ENST00000583319 53 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 AC009041.4-201ENST00000620075 638 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 AL034417.3-201ENST00000641100 1043 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 MBIP-211ENST00000621657 1809 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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