Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 MAMDC4-201ENST00000317446 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 RBMS1-201ENST00000348849 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 ADM2-202ENST00000395738 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 POLD1-201ENST00000440232 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 PGBD1-201ENST00000259883 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 FAM90A26-201ENST00000512047 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 STAT6-202ENST00000454075 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 ENOX2-204ENST00000394363 4174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 ZBTB44-202ENST00000397753 3951 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 DIDO1-204ENST00000370368 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 PLA2G6-202ENST00000335539 3060 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 USP17L7-201ENST00000530447 2022 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 MFSD8-241ENST00000641686 4991 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 NLRP2-202ENST00000339757 3422 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 SLFNL1-AS1-201ENST00000626479 4800 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 AC011481.3-201ENST00000623895 5594 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
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UBXN4Q92575 KCNN1-201ENST00000222249 3625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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UBXN4Q92575 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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UBXN4Q92575 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
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UBXN4Q92575 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 AC022364.1-202ENST00000617468 2409 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 TAX1BP1-207ENST00000433216 3174 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 HSPA2-201ENST00000247207 2767 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
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