Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 TSTD1-206ENST00000466967 477 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 MST1L-204ENST00000545160 559 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 AL512356.1-201ENST00000548203 535 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 DTWD1-205ENST00000558653 1131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 PSME2-217ENST00000615264 874 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 PSME2-218ENST00000630027 185 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 GSTT2-203ENST00000634759 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 AL590556.2-202ENST00000636906 844 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 KRT8P38-201ENST00000441370 1430 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 MRPS28-201ENST00000276585 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 NR2C2AP-201ENST00000331552 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 WFDC2-203ENST00000342873 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 GYG2-201ENST00000353656 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 OR2W3-201ENST00000360358 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 CHEK2-203ENST00000382565 696 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 FOLR1-204ENST00000393681 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 SDCBP2P1-201ENST00000416115 614 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 NR2C2AP-202ENST00000420605 859 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 B9D1-206ENST00000461069 923 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 AC022447.5-201ENST00000504817 392 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 AC117834.1-201ENST00000523197 602 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 C1orf198-207ENST00000523410 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 AL161668.2-201ENST00000531638 492 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 AP003040.1-201ENST00000532044 1024 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 LINC00643-202ENST00000553426 526 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 AL445363.2-201ENST00000554608 837 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 YWHAE-212ENST00000575977 540 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 MIR5091-201ENST00000578707 93 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 AL445363.1-201ENST00000623749 952 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 COG6-212ENST00000630730 186 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 TAMM41-201ENST00000273037 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 CELA3A-201ENST00000290122 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 KIR2DL4-207ENST00000396293 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 INMT-202ENST00000409539 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 CORO1C-203ENST00000421578 1296 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 CBR3-AS1-202ENST00000427491 741 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 AC010997.2-201ENST00000427610 260 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 AL353653.1-201ENST00000452336 638 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 NDUFB2P1-201ENST00000506966 295 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 RNA5SP420-201ENST00000516997 137 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 IMMP1L-213ENST00000533642 314 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 SLC25A3-206ENST00000547534 556 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 AC009065.4-201ENST00000563734 543 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 PCTP-206ENST00000573500 919 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 LINC01444-201ENST00000580867 764 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 RN7SL478P-201ENST00000584358 298 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 LINC00969-241ENST00000600527 852 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms