Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NIPSNAP2O75323 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms