Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms