Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 ILF3-201ENST00000250241 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 VSTM2A-201ENST00000302287 3401 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 SH2D7-201ENST00000328828 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 USP17L7-201ENST00000530447 2022 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 CCDC144NL-201ENST00000327925 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC14.15□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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