Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 MECOM-206ENST00000464456 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 CHD4-211ENST00000544484 6554 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 NKAP-201ENST00000371410 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 BSDC1-201ENST00000341071 4599 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 BCL2L13-214ENST00000543133 4975 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 BCL2L13-217ENST00000618481 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 GSTM3-201ENST00000256594 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 TCF3-220ENST00000611869 4409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 PPP1R26P2-201ENST00000611403 3595 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 VWA5B1-201ENST00000289815 4475 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 RNFT2-201ENST00000257575 3882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 GRAMD1B-216ENST00000638157 3849 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 FAM53B-203ENST00000392754 3557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 CT62-203ENST00000566432 2822 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 CCDC14-220ENST00000488653 4156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 BTBD3-204ENST00000405977 5137 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 RNF111-201ENST00000348370 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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IFFO1Q0D2I5 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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IFFO1Q0D2I5 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 PAX2-203ENST00000370296 4140 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 PAX2-205ENST00000428433 4126 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 HTR5A-201ENST00000287907 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 ELN-234ENST00000621115 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 DNMT3B-203ENST00000348286 4048 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 MESD-201ENST00000261758 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 KCNT1-213ENST00000630792 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 PHF19-202ENST00000373896 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 HLCS-207ENST00000612277 6112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 GPC4-201ENST00000370828 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 TCF3-202ENST00000344749 4289 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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