Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CD247P20963 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CD247P20963 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CD247P20963 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CD247P20963 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CD247P20963 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CD247P20963 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CD247P20963 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CD247P20963 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CD247P20963 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CD247P20963 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CD247P20963 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CD247P20963 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CD247P20963 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CD247P20963 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CD247P20963 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CD247P20963 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CD247P20963 PACSIN2-202ENST00000337959 3149 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CD247P20963 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CD247P20963 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CD247P20963 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CD247P20963 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CD247P20963 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CD247P20963 ANKRD20A1-201ENST00000562196 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CD247P20963 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CD247P20963 ZBED8-201ENST00000408953 2851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CD247P20963 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CD247P20963 SLC26A6-205ENST00000395550 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CD247P20963 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CD247P20963 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CD247P20963 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CD247P20963 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CD247P20963 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CD247P20963 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CD247P20963 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CD247P20963 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CD247P20963 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CD247P20963 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CD247P20963 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CD247P20963 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CD247P20963 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CD247P20963 ALKBH5-201ENST00000399138 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CD247P20963 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CD247P20963 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CD247P20963 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CD247P20963 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CD247P20963 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CD247P20963 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CD247P20963 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CD247P20963 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CD247P20963 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CD247P20963 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CD247P20963 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CD247P20963 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CD247P20963 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CD247P20963 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CD247P20963 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CD247P20963 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CD247P20963 GRIPAP1-215ENST00000622599 2881 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CD247P20963 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CD247P20963 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CD247P20963 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CD247P20963 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CD247P20963 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CD247P20963 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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CD247P20963 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CD247P20963 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CD247P20963 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CD247P20963 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CD247P20963 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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CD247P20963 KCNMA1-232ENST00000638306 3811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CD247P20963 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CD247P20963 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CD247P20963 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CD247P20963 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CD247P20963 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CD247P20963 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CD247P20963 LINC02015-202ENST00000436078 2957 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CD247P20963 MCRIP1-212ENST00000576730 2979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CD247P20963 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CD247P20963 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CD247P20963 BCAM-211ENST00000611077 3430 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CD247P20963 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CD247P20963 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CD247P20963 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CD247P20963 TRIM3-203ENST00000525074 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CD247P20963 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CD247P20963 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CD247P20963 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CD247P20963 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CD247P20963 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CD247P20963 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CD247P20963 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CD247P20963 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CD247P20963 ITGA3-201ENST00000007722 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CD247P20963 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CD247P20963 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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