Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E1

WASHC2C, WASH complex subunit 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2CQ9Y4E1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
WASHC2CQ9Y4E1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
WASHC2CQ9Y4E1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
WASHC2CQ9Y4E1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
WASHC2CQ9Y4E1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
WASHC2CQ9Y4E1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
WASHC2CQ9Y4E1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
WASHC2CQ9Y4E1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
WASHC2CQ9Y4E1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
WASHC2CQ9Y4E1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.94
WASHC2CQ9Y4E1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
WASHC2CQ9Y4E1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
WASHC2CQ9Y4E1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
WASHC2CQ9Y4E1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
WASHC2CQ9Y4E1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
WASHC2CQ9Y4E1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
WASHC2CQ9Y4E1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
WASHC2CQ9Y4E1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
WASHC2CQ9Y4E1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
WASHC2CQ9Y4E1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
WASHC2CQ9Y4E1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
WASHC2CQ9Y4E1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
WASHC2CQ9Y4E1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
WASHC2CQ9Y4E1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
WASHC2CQ9Y4E1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
WASHC2CQ9Y4E1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
WASHC2CQ9Y4E1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
WASHC2CQ9Y4E1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
WASHC2CQ9Y4E1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
WASHC2CQ9Y4E1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
WASHC2CQ9Y4E1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
WASHC2CQ9Y4E1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
WASHC2CQ9Y4E1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
WASHC2CQ9Y4E1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
WASHC2CQ9Y4E1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
WASHC2CQ9Y4E1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
WASHC2CQ9Y4E1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
WASHC2CQ9Y4E1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
WASHC2CQ9Y4E1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
WASHC2CQ9Y4E1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
WASHC2CQ9Y4E1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
WASHC2CQ9Y4E1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
WASHC2CQ9Y4E1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
WASHC2CQ9Y4E1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
WASHC2CQ9Y4E1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
WASHC2CQ9Y4E1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
WASHC2CQ9Y4E1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
WASHC2CQ9Y4E1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC33.32■■■□□ 2.93
WASHC2CQ9Y4E1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
WASHC2CQ9Y4E1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
WASHC2CQ9Y4E1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
WASHC2CQ9Y4E1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
WASHC2CQ9Y4E1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
WASHC2CQ9Y4E1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
WASHC2CQ9Y4E1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
WASHC2CQ9Y4E1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
WASHC2CQ9Y4E1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
WASHC2CQ9Y4E1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
WASHC2CQ9Y4E1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
WASHC2CQ9Y4E1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
WASHC2CQ9Y4E1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
WASHC2CQ9Y4E1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
WASHC2CQ9Y4E1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
WASHC2CQ9Y4E1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
WASHC2CQ9Y4E1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
WASHC2CQ9Y4E1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
WASHC2CQ9Y4E1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
WASHC2CQ9Y4E1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
WASHC2CQ9Y4E1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
WASHC2CQ9Y4E1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
WASHC2CQ9Y4E1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
WASHC2CQ9Y4E1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
WASHC2CQ9Y4E1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
WASHC2CQ9Y4E1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
WASHC2CQ9Y4E1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
WASHC2CQ9Y4E1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
WASHC2CQ9Y4E1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
WASHC2CQ9Y4E1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
WASHC2CQ9Y4E1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
WASHC2CQ9Y4E1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
WASHC2CQ9Y4E1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC33.28■■■□□ 2.92
WASHC2CQ9Y4E1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
WASHC2CQ9Y4E1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
WASHC2CQ9Y4E1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
WASHC2CQ9Y4E1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
WASHC2CQ9Y4E1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
WASHC2CQ9Y4E1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
WASHC2CQ9Y4E1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
WASHC2CQ9Y4E1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
WASHC2CQ9Y4E1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
WASHC2CQ9Y4E1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
WASHC2CQ9Y4E1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
WASHC2CQ9Y4E1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
WASHC2CQ9Y4E1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
WASHC2CQ9Y4E1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.91
WASHC2CQ9Y4E1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
WASHC2CQ9Y4E1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
WASHC2CQ9Y4E1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
WASHC2CQ9Y4E1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
WASHC2CQ9Y4E1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms