Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM07

PADI4, Protein-arginine deiminase type-4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI4Q9UM07 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PADI4Q9UM07 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PADI4Q9UM07 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PADI4Q9UM07 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PADI4Q9UM07 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PADI4Q9UM07 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PADI4Q9UM07 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PADI4Q9UM07 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PADI4Q9UM07 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PADI4Q9UM07 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PADI4Q9UM07 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PADI4Q9UM07 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PADI4Q9UM07 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PADI4Q9UM07 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PADI4Q9UM07 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PADI4Q9UM07 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PADI4Q9UM07 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PADI4Q9UM07 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PADI4Q9UM07 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PADI4Q9UM07 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PADI4Q9UM07 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PADI4Q9UM07 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PADI4Q9UM07 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PADI4Q9UM07 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PADI4Q9UM07 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PADI4Q9UM07 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PADI4Q9UM07 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PADI4Q9UM07 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PADI4Q9UM07 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PADI4Q9UM07 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PADI4Q9UM07 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PADI4Q9UM07 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PADI4Q9UM07 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PADI4Q9UM07 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PADI4Q9UM07 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PADI4Q9UM07 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PADI4Q9UM07 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PADI4Q9UM07 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PADI4Q9UM07 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PADI4Q9UM07 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PADI4Q9UM07 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PADI4Q9UM07 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PADI4Q9UM07 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PADI4Q9UM07 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PADI4Q9UM07 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PADI4Q9UM07 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PADI4Q9UM07 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PADI4Q9UM07 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PADI4Q9UM07 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PADI4Q9UM07 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PADI4Q9UM07 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PADI4Q9UM07 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PADI4Q9UM07 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PADI4Q9UM07 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PADI4Q9UM07 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PADI4Q9UM07 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PADI4Q9UM07 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PADI4Q9UM07 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PADI4Q9UM07 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PADI4Q9UM07 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PADI4Q9UM07 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PADI4Q9UM07 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PADI4Q9UM07 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PADI4Q9UM07 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PADI4Q9UM07 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PADI4Q9UM07 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PADI4Q9UM07 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PADI4Q9UM07 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PADI4Q9UM07 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PADI4Q9UM07 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PADI4Q9UM07 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PADI4Q9UM07 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PADI4Q9UM07 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PADI4Q9UM07 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PADI4Q9UM07 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PADI4Q9UM07 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PADI4Q9UM07 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PADI4Q9UM07 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PADI4Q9UM07 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PADI4Q9UM07 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PADI4Q9UM07 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PADI4Q9UM07 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PADI4Q9UM07 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PADI4Q9UM07 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PADI4Q9UM07 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PADI4Q9UM07 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PADI4Q9UM07 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PADI4Q9UM07 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PADI4Q9UM07 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PADI4Q9UM07 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PADI4Q9UM07 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PADI4Q9UM07 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PADI4Q9UM07 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PADI4Q9UM07 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PADI4Q9UM07 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PADI4Q9UM07 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PADI4Q9UM07 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PADI4Q9UM07 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PADI4Q9UM07 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PADI4Q9UM07 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms