Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULZ9

MMP17, Matrix metalloproteinase-17, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP17Q9ULZ9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP17Q9ULZ9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP17Q9ULZ9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP17Q9ULZ9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP17Q9ULZ9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP17Q9ULZ9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP17Q9ULZ9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP17Q9ULZ9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP17Q9ULZ9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP17Q9ULZ9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP17Q9ULZ9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP17Q9ULZ9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MMP17Q9ULZ9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MMP17Q9ULZ9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms