Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DKK4Q9UBT3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DKK4Q9UBT3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DKK4Q9UBT3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DKK4Q9UBT3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DKK4Q9UBT3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DKK4Q9UBT3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DKK4Q9UBT3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DKK4Q9UBT3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DKK4Q9UBT3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DKK4Q9UBT3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DKK4Q9UBT3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DKK4Q9UBT3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.28■■□□□ 1
DKK4Q9UBT3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DKK4Q9UBT3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DKK4Q9UBT3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DKK4Q9UBT3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DKK4Q9UBT3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DKK4Q9UBT3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DKK4Q9UBT3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DKK4Q9UBT3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DKK4Q9UBT3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DKK4Q9UBT3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DKK4Q9UBT3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DKK4Q9UBT3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DKK4Q9UBT3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DKK4Q9UBT3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DKK4Q9UBT3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
DKK4Q9UBT3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DKK4Q9UBT3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DKK4Q9UBT3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DKK4Q9UBT3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DKK4Q9UBT3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DKK4Q9UBT3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DKK4Q9UBT3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DKK4Q9UBT3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DKK4Q9UBT3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DKK4Q9UBT3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DKK4Q9UBT3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DKK4Q9UBT3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DKK4Q9UBT3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DKK4Q9UBT3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DKK4Q9UBT3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DKK4Q9UBT3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DKK4Q9UBT3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DKK4Q9UBT3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DKK4Q9UBT3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DKK4Q9UBT3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DKK4Q9UBT3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DKK4Q9UBT3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DKK4Q9UBT3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DKK4Q9UBT3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DKK4Q9UBT3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DKK4Q9UBT3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DKK4Q9UBT3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DKK4Q9UBT3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DKK4Q9UBT3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DKK4Q9UBT3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DKK4Q9UBT3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DKK4Q9UBT3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DKK4Q9UBT3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DKK4Q9UBT3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DKK4Q9UBT3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DKK4Q9UBT3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DKK4Q9UBT3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DKK4Q9UBT3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DKK4Q9UBT3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DKK4Q9UBT3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DKK4Q9UBT3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DKK4Q9UBT3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DKK4Q9UBT3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
DKK4Q9UBT3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
DKK4Q9UBT3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DKK4Q9UBT3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DKK4Q9UBT3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DKK4Q9UBT3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
DKK4Q9UBT3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DKK4Q9UBT3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DKK4Q9UBT3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DKK4Q9UBT3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DKK4Q9UBT3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DKK4Q9UBT3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DKK4Q9UBT3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DKK4Q9UBT3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
DKK4Q9UBT3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DKK4Q9UBT3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
DKK4Q9UBT3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DKK4Q9UBT3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DKK4Q9UBT3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DKK4Q9UBT3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DKK4Q9UBT3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DKK4Q9UBT3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DKK4Q9UBT3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DKK4Q9UBT3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DKK4Q9UBT3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DKK4Q9UBT3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
DKK4Q9UBT3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DKK4Q9UBT3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DKK4Q9UBT3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DKK4Q9UBT3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms