Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
USP35Q9P2H5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
USP35Q9P2H5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
USP35Q9P2H5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
USP35Q9P2H5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
USP35Q9P2H5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
USP35Q9P2H5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
USP35Q9P2H5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
USP35Q9P2H5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
USP35Q9P2H5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
USP35Q9P2H5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
USP35Q9P2H5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
USP35Q9P2H5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
USP35Q9P2H5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
USP35Q9P2H5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
USP35Q9P2H5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
USP35Q9P2H5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
USP35Q9P2H5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
USP35Q9P2H5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC30.4■■■□□ 2.46
USP35Q9P2H5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
USP35Q9P2H5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
USP35Q9P2H5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
USP35Q9P2H5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
USP35Q9P2H5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
USP35Q9P2H5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
USP35Q9P2H5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
USP35Q9P2H5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
USP35Q9P2H5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
USP35Q9P2H5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
USP35Q9P2H5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
USP35Q9P2H5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
USP35Q9P2H5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
USP35Q9P2H5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
USP35Q9P2H5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
USP35Q9P2H5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
USP35Q9P2H5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
USP35Q9P2H5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
USP35Q9P2H5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
USP35Q9P2H5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
USP35Q9P2H5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
USP35Q9P2H5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
USP35Q9P2H5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC30.37■■■□□ 2.45
USP35Q9P2H5 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
USP35Q9P2H5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
USP35Q9P2H5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
USP35Q9P2H5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
USP35Q9P2H5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
USP35Q9P2H5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
USP35Q9P2H5 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
USP35Q9P2H5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
USP35Q9P2H5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
USP35Q9P2H5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
USP35Q9P2H5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
USP35Q9P2H5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC30.36■■■□□ 2.45
USP35Q9P2H5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
USP35Q9P2H5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
USP35Q9P2H5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
USP35Q9P2H5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
USP35Q9P2H5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
USP35Q9P2H5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
USP35Q9P2H5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
USP35Q9P2H5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
USP35Q9P2H5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
USP35Q9P2H5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
USP35Q9P2H5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
USP35Q9P2H5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
USP35Q9P2H5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
USP35Q9P2H5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
USP35Q9P2H5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
USP35Q9P2H5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
USP35Q9P2H5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
USP35Q9P2H5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
USP35Q9P2H5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
USP35Q9P2H5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
USP35Q9P2H5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
USP35Q9P2H5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
USP35Q9P2H5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
USP35Q9P2H5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
USP35Q9P2H5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
USP35Q9P2H5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
USP35Q9P2H5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
USP35Q9P2H5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
USP35Q9P2H5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
USP35Q9P2H5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
USP35Q9P2H5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
USP35Q9P2H5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
USP35Q9P2H5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
USP35Q9P2H5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
USP35Q9P2H5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
USP35Q9P2H5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
USP35Q9P2H5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
USP35Q9P2H5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
USP35Q9P2H5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
USP35Q9P2H5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
USP35Q9P2H5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
USP35Q9P2H5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
USP35Q9P2H5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
USP35Q9P2H5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
USP35Q9P2H5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
USP35Q9P2H5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
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