Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX07

TRNAU1AP, tRNA selenocysteine 1-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNAU1APQ9NX07 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRNAU1APQ9NX07 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRNAU1APQ9NX07 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRNAU1APQ9NX07 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRNAU1APQ9NX07 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRNAU1APQ9NX07 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRNAU1APQ9NX07 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TRNAU1APQ9NX07 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRNAU1APQ9NX07 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRNAU1APQ9NX07 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRNAU1APQ9NX07 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRNAU1APQ9NX07 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRNAU1APQ9NX07 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRNAU1APQ9NX07 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TRNAU1APQ9NX07 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TRNAU1APQ9NX07 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TRNAU1APQ9NX07 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRNAU1APQ9NX07 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TRNAU1APQ9NX07 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRNAU1APQ9NX07 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRNAU1APQ9NX07 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRNAU1APQ9NX07 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRNAU1APQ9NX07 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRNAU1APQ9NX07 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRNAU1APQ9NX07 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRNAU1APQ9NX07 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRNAU1APQ9NX07 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRNAU1APQ9NX07 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRNAU1APQ9NX07 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRNAU1APQ9NX07 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRNAU1APQ9NX07 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRNAU1APQ9NX07 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRNAU1APQ9NX07 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRNAU1APQ9NX07 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRNAU1APQ9NX07 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRNAU1APQ9NX07 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRNAU1APQ9NX07 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRNAU1APQ9NX07 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRNAU1APQ9NX07 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRNAU1APQ9NX07 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRNAU1APQ9NX07 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRNAU1APQ9NX07 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRNAU1APQ9NX07 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRNAU1APQ9NX07 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRNAU1APQ9NX07 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRNAU1APQ9NX07 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRNAU1APQ9NX07 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRNAU1APQ9NX07 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRNAU1APQ9NX07 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRNAU1APQ9NX07 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRNAU1APQ9NX07 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRNAU1APQ9NX07 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRNAU1APQ9NX07 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRNAU1APQ9NX07 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRNAU1APQ9NX07 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRNAU1APQ9NX07 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRNAU1APQ9NX07 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRNAU1APQ9NX07 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRNAU1APQ9NX07 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRNAU1APQ9NX07 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRNAU1APQ9NX07 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRNAU1APQ9NX07 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRNAU1APQ9NX07 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRNAU1APQ9NX07 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRNAU1APQ9NX07 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRNAU1APQ9NX07 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRNAU1APQ9NX07 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRNAU1APQ9NX07 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRNAU1APQ9NX07 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRNAU1APQ9NX07 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRNAU1APQ9NX07 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRNAU1APQ9NX07 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRNAU1APQ9NX07 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRNAU1APQ9NX07 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRNAU1APQ9NX07 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRNAU1APQ9NX07 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRNAU1APQ9NX07 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRNAU1APQ9NX07 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRNAU1APQ9NX07 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRNAU1APQ9NX07 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRNAU1APQ9NX07 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRNAU1APQ9NX07 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRNAU1APQ9NX07 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRNAU1APQ9NX07 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRNAU1APQ9NX07 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRNAU1APQ9NX07 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRNAU1APQ9NX07 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRNAU1APQ9NX07 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRNAU1APQ9NX07 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRNAU1APQ9NX07 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRNAU1APQ9NX07 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRNAU1APQ9NX07 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRNAU1APQ9NX07 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRNAU1APQ9NX07 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRNAU1APQ9NX07 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRNAU1APQ9NX07 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRNAU1APQ9NX07 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRNAU1APQ9NX07 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRNAU1APQ9NX07 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRNAU1APQ9NX07 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 941.5 ms