Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW7

C2orf42, Uncharacterized protein C2orf42, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf42Q9NWW7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C2orf42Q9NWW7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C2orf42Q9NWW7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C2orf42Q9NWW7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C2orf42Q9NWW7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C2orf42Q9NWW7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
C2orf42Q9NWW7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C2orf42Q9NWW7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C2orf42Q9NWW7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C2orf42Q9NWW7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C2orf42Q9NWW7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C2orf42Q9NWW7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C2orf42Q9NWW7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C2orf42Q9NWW7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C2orf42Q9NWW7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
C2orf42Q9NWW7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C2orf42Q9NWW7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C2orf42Q9NWW7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C2orf42Q9NWW7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
C2orf42Q9NWW7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C2orf42Q9NWW7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C2orf42Q9NWW7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C2orf42Q9NWW7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C2orf42Q9NWW7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C2orf42Q9NWW7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C2orf42Q9NWW7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C2orf42Q9NWW7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
C2orf42Q9NWW7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C2orf42Q9NWW7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C2orf42Q9NWW7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C2orf42Q9NWW7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C2orf42Q9NWW7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C2orf42Q9NWW7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C2orf42Q9NWW7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C2orf42Q9NWW7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C2orf42Q9NWW7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C2orf42Q9NWW7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C2orf42Q9NWW7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C2orf42Q9NWW7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C2orf42Q9NWW7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C2orf42Q9NWW7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C2orf42Q9NWW7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C2orf42Q9NWW7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C2orf42Q9NWW7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C2orf42Q9NWW7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C2orf42Q9NWW7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C2orf42Q9NWW7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C2orf42Q9NWW7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C2orf42Q9NWW7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
C2orf42Q9NWW7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C2orf42Q9NWW7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C2orf42Q9NWW7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C2orf42Q9NWW7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C2orf42Q9NWW7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C2orf42Q9NWW7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
C2orf42Q9NWW7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C2orf42Q9NWW7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C2orf42Q9NWW7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C2orf42Q9NWW7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C2orf42Q9NWW7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
C2orf42Q9NWW7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C2orf42Q9NWW7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C2orf42Q9NWW7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C2orf42Q9NWW7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C2orf42Q9NWW7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C2orf42Q9NWW7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
C2orf42Q9NWW7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C2orf42Q9NWW7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C2orf42Q9NWW7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C2orf42Q9NWW7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C2orf42Q9NWW7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C2orf42Q9NWW7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
C2orf42Q9NWW7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C2orf42Q9NWW7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C2orf42Q9NWW7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C2orf42Q9NWW7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C2orf42Q9NWW7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C2orf42Q9NWW7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C2orf42Q9NWW7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C2orf42Q9NWW7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C2orf42Q9NWW7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C2orf42Q9NWW7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C2orf42Q9NWW7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C2orf42Q9NWW7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C2orf42Q9NWW7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C2orf42Q9NWW7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C2orf42Q9NWW7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C2orf42Q9NWW7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C2orf42Q9NWW7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C2orf42Q9NWW7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C2orf42Q9NWW7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C2orf42Q9NWW7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C2orf42Q9NWW7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
C2orf42Q9NWW7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C2orf42Q9NWW7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C2orf42Q9NWW7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
C2orf42Q9NWW7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C2orf42Q9NWW7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C2orf42Q9NWW7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C2orf42Q9NWW7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms