Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUP7

TRMT13, tRNA:m(4)X modification enzyme TRM13 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT13Q9NUP7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRMT13Q9NUP7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRMT13Q9NUP7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRMT13Q9NUP7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRMT13Q9NUP7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRMT13Q9NUP7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRMT13Q9NUP7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRMT13Q9NUP7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRMT13Q9NUP7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRMT13Q9NUP7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRMT13Q9NUP7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRMT13Q9NUP7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRMT13Q9NUP7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRMT13Q9NUP7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRMT13Q9NUP7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRMT13Q9NUP7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRMT13Q9NUP7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRMT13Q9NUP7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRMT13Q9NUP7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TRMT13Q9NUP7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRMT13Q9NUP7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRMT13Q9NUP7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRMT13Q9NUP7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRMT13Q9NUP7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRMT13Q9NUP7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRMT13Q9NUP7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TRMT13Q9NUP7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRMT13Q9NUP7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRMT13Q9NUP7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRMT13Q9NUP7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRMT13Q9NUP7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRMT13Q9NUP7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRMT13Q9NUP7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRMT13Q9NUP7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRMT13Q9NUP7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRMT13Q9NUP7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRMT13Q9NUP7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRMT13Q9NUP7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRMT13Q9NUP7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TRMT13Q9NUP7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRMT13Q9NUP7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TRMT13Q9NUP7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRMT13Q9NUP7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRMT13Q9NUP7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRMT13Q9NUP7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRMT13Q9NUP7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRMT13Q9NUP7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRMT13Q9NUP7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TRMT13Q9NUP7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRMT13Q9NUP7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRMT13Q9NUP7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRMT13Q9NUP7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRMT13Q9NUP7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRMT13Q9NUP7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRMT13Q9NUP7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRMT13Q9NUP7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRMT13Q9NUP7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRMT13Q9NUP7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRMT13Q9NUP7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRMT13Q9NUP7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRMT13Q9NUP7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRMT13Q9NUP7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRMT13Q9NUP7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRMT13Q9NUP7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRMT13Q9NUP7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRMT13Q9NUP7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRMT13Q9NUP7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TRMT13Q9NUP7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRMT13Q9NUP7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRMT13Q9NUP7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRMT13Q9NUP7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRMT13Q9NUP7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRMT13Q9NUP7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRMT13Q9NUP7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TRMT13Q9NUP7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRMT13Q9NUP7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRMT13Q9NUP7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRMT13Q9NUP7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TRMT13Q9NUP7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRMT13Q9NUP7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRMT13Q9NUP7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRMT13Q9NUP7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRMT13Q9NUP7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRMT13Q9NUP7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRMT13Q9NUP7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRMT13Q9NUP7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRMT13Q9NUP7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRMT13Q9NUP7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRMT13Q9NUP7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRMT13Q9NUP7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRMT13Q9NUP7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRMT13Q9NUP7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRMT13Q9NUP7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRMT13Q9NUP7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRMT13Q9NUP7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRMT13Q9NUP7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TRMT13Q9NUP7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRMT13Q9NUP7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRMT13Q9NUP7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRMT13Q9NUP7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms