Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ASCL3Q9NQ33 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ASCL3Q9NQ33 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ASCL3Q9NQ33 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ASCL3Q9NQ33 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ASCL3Q9NQ33 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ASCL3Q9NQ33 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ASCL3Q9NQ33 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ASCL3Q9NQ33 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ASCL3Q9NQ33 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ASCL3Q9NQ33 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ASCL3Q9NQ33 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ASCL3Q9NQ33 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ASCL3Q9NQ33 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ASCL3Q9NQ33 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ASCL3Q9NQ33 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ASCL3Q9NQ33 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ASCL3Q9NQ33 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ASCL3Q9NQ33 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ASCL3Q9NQ33 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ASCL3Q9NQ33 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ASCL3Q9NQ33 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ASCL3Q9NQ33 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ASCL3Q9NQ33 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ASCL3Q9NQ33 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ASCL3Q9NQ33 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ASCL3Q9NQ33 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ASCL3Q9NQ33 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ASCL3Q9NQ33 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ASCL3Q9NQ33 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ASCL3Q9NQ33 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ASCL3Q9NQ33 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ASCL3Q9NQ33 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ASCL3Q9NQ33 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ASCL3Q9NQ33 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ASCL3Q9NQ33 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ASCL3Q9NQ33 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ASCL3Q9NQ33 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ASCL3Q9NQ33 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ASCL3Q9NQ33 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ASCL3Q9NQ33 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ASCL3Q9NQ33 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASCL3Q9NQ33 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASCL3Q9NQ33 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ASCL3Q9NQ33 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASCL3Q9NQ33 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASCL3Q9NQ33 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASCL3Q9NQ33 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASCL3Q9NQ33 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASCL3Q9NQ33 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASCL3Q9NQ33 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASCL3Q9NQ33 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASCL3Q9NQ33 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASCL3Q9NQ33 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASCL3Q9NQ33 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASCL3Q9NQ33 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASCL3Q9NQ33 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ASCL3Q9NQ33 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ASCL3Q9NQ33 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ASCL3Q9NQ33 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ASCL3Q9NQ33 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ASCL3Q9NQ33 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ASCL3Q9NQ33 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ASCL3Q9NQ33 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ASCL3Q9NQ33 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ASCL3Q9NQ33 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ASCL3Q9NQ33 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ASCL3Q9NQ33 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ASCL3Q9NQ33 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ASCL3Q9NQ33 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ASCL3Q9NQ33 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ASCL3Q9NQ33 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ASCL3Q9NQ33 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASCL3Q9NQ33 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASCL3Q9NQ33 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASCL3Q9NQ33 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASCL3Q9NQ33 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASCL3Q9NQ33 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASCL3Q9NQ33 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ASCL3Q9NQ33 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASCL3Q9NQ33 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASCL3Q9NQ33 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASCL3Q9NQ33 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASCL3Q9NQ33 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASCL3Q9NQ33 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASCL3Q9NQ33 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASCL3Q9NQ33 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASCL3Q9NQ33 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ASCL3Q9NQ33 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ASCL3Q9NQ33 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ASCL3Q9NQ33 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ASCL3Q9NQ33 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ASCL3Q9NQ33 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ASCL3Q9NQ33 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ASCL3Q9NQ33 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ASCL3Q9NQ33 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ASCL3Q9NQ33 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ASCL3Q9NQ33 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ASCL3Q9NQ33 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ASCL3Q9NQ33 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms