Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ0

TNRC6C, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6CQ9HCJ0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNRC6CQ9HCJ0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNRC6CQ9HCJ0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TNRC6CQ9HCJ0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TNRC6CQ9HCJ0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TNRC6CQ9HCJ0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TNRC6CQ9HCJ0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TNRC6CQ9HCJ0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TNRC6CQ9HCJ0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TNRC6CQ9HCJ0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TNRC6CQ9HCJ0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TNRC6CQ9HCJ0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TNRC6CQ9HCJ0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNRC6CQ9HCJ0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNRC6CQ9HCJ0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNRC6CQ9HCJ0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNRC6CQ9HCJ0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNRC6CQ9HCJ0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNRC6CQ9HCJ0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNRC6CQ9HCJ0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNRC6CQ9HCJ0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TNRC6CQ9HCJ0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TNRC6CQ9HCJ0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TNRC6CQ9HCJ0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TNRC6CQ9HCJ0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TNRC6CQ9HCJ0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TNRC6CQ9HCJ0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TNRC6CQ9HCJ0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TNRC6CQ9HCJ0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TNRC6CQ9HCJ0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNRC6CQ9HCJ0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNRC6CQ9HCJ0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNRC6CQ9HCJ0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNRC6CQ9HCJ0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNRC6CQ9HCJ0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNRC6CQ9HCJ0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNRC6CQ9HCJ0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNRC6CQ9HCJ0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNRC6CQ9HCJ0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNRC6CQ9HCJ0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNRC6CQ9HCJ0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNRC6CQ9HCJ0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNRC6CQ9HCJ0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNRC6CQ9HCJ0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNRC6CQ9HCJ0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNRC6CQ9HCJ0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNRC6CQ9HCJ0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNRC6CQ9HCJ0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNRC6CQ9HCJ0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNRC6CQ9HCJ0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNRC6CQ9HCJ0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNRC6CQ9HCJ0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNRC6CQ9HCJ0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNRC6CQ9HCJ0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TNRC6CQ9HCJ0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNRC6CQ9HCJ0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNRC6CQ9HCJ0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNRC6CQ9HCJ0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNRC6CQ9HCJ0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNRC6CQ9HCJ0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNRC6CQ9HCJ0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNRC6CQ9HCJ0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNRC6CQ9HCJ0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNRC6CQ9HCJ0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNRC6CQ9HCJ0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNRC6CQ9HCJ0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNRC6CQ9HCJ0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNRC6CQ9HCJ0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNRC6CQ9HCJ0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TNRC6CQ9HCJ0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNRC6CQ9HCJ0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNRC6CQ9HCJ0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNRC6CQ9HCJ0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNRC6CQ9HCJ0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNRC6CQ9HCJ0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TNRC6CQ9HCJ0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNRC6CQ9HCJ0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
TNRC6CQ9HCJ0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNRC6CQ9HCJ0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNRC6CQ9HCJ0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TNRC6CQ9HCJ0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNRC6CQ9HCJ0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNRC6CQ9HCJ0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNRC6CQ9HCJ0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNRC6CQ9HCJ0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNRC6CQ9HCJ0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNRC6CQ9HCJ0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNRC6CQ9HCJ0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNRC6CQ9HCJ0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNRC6CQ9HCJ0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNRC6CQ9HCJ0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNRC6CQ9HCJ0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNRC6CQ9HCJ0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNRC6CQ9HCJ0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNRC6CQ9HCJ0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNRC6CQ9HCJ0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNRC6CQ9HCJ0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
TNRC6CQ9HCJ0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNRC6CQ9HCJ0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNRC6CQ9HCJ0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms